台灣本島地形陡峻、地質年輕且構造脆弱，加上豪雨、地震的作用，山坡地經常發生沖蝕、崩塌、土石流等災害。集水區上游山坡地為森林覆蓋區域，亦為水資源來源區域，土壤沖蝕、崩塌的敏感地區，也是動植物的重要棲息地，由於集水區內包含森林等等多樣的自然資源，需擬訂妥善經營計畫，降低自然災害的潛勢，避免人為活動而產生不可回復的影響。
近年來人口增加、產業發展，面臨水資源、土地資源利用需求的壓力，並且在環境保護、生態系永續性經營等受到相當的重視之下，集水區自然資源整合性經營更顯得重要。
集水區經營為一門與地形、地質、土壤、氣象、水文、水土保持、經濟評估等有關的綜合性課程。課程內容包括集水區經營相關法規，地形、降雨、逕流分析，坡面沖蝕、崩塌特性，土地利用對水文、土壤沖蝕的影響，經營計畫的擬訂及可行性評估等。